Shopifyの決済方法一覧｜日本向け決済の導入ガイド

自社ストアをShopifyで立ち上げるとき、どの決済を用意するかは購入直前の離脱を左右する判断です。クレジットカードはShopifyの標準機能でまかなえますが、コンビニ払いやPayPay、後払いをどこまでそろえるか、手数料はどの程度かは、公開前に整理しておきたいところです。

決済は、Shopifyの標準機能でどこまで対応でき、何を外部サービスで補うのか。その線引きと、

ターゲット顧客に合う組み合わせが決まれば、過不足のない構成でスタートできます。

本記事では、Shopifyで利用できる決済方法を「Shopifyの標準機能か外部サービスか」「手数料」「対応状況」で一覧化し、最初に導入したいShopifyペイメントから、顧客層に応じて追加する決済、追加時のコストと運用負担までを順に整理します。国内販売を前提に、自社に必要な決済を選定できる状態を目指します。

1.Shopifyの決済は、標準機能で使える分と外部で足す分に分かれる

決済の選択肢は数が多く、一つずつ検討すると判断に時間がかかります。先に全体像を把握できれば、自社に必要な決済だけを絞り込めます。この章では、Shopifyの標準機能と外部サービスの境界を整理したうえで、主要な決済を一覧表にまとめます。

1-1. 外部アプリ導入で広がる決済の選択肢

Shopifyを契約してすぐに使えるのは、クレジットカードを中心とした決済です。Visa・Mastercard・JCB・American Expressの各カードに加え、Apple Pay・Google Pay・Shop Payまでが、Shopifyの標準機能であるShopifyペイメントでまかなえます。一方、コンビニ払い・後払い・PayPayなどのQR決済・キャリア決済は、外部の決済代行サービスを追加して使う領域です。

この線引きは、Shopifyが海外発のプラットフォームであることに由来します。標準機能はカード決済を軸に設計されており、カード以外は標準では用意されていません。

実際、ストア構築の段階で決済設定を開くと、カードは設定できてもPayPayやコンビニ払いの項目が見当たらず、追加方法を探す場面が出てきます。以前はAmazon Payも選べましたが、日本のShopifyストアでは2025年1月に終了しており、現在は選択肢から外れています。

決済は最初からすべてをそろえる必要はありません。Shopifyの標準機能で対応できる範囲と、外部サービスで補う範囲。この順で切り分けておくと、開店時に用意する決済を無駄なく絞り込めます。

1-2. Shopifyの決済方法・手数料・対応状況の一覧

主要な決済を、Shopifyの標準機能で使えるか外部サービスで補うか・導入の可否・手数料の目安の3点で一覧にしました。自社に必要な決済を選ぶ際の判断材料としてご覧ください。

決済方法	区分	可否	手数料・備考
クレジットカード（Visa／Mastercard／JCB／Amex）	標準機能 （Shopifyペイメント）	◯	国内カード3.25〜3.55%（プランで変動）※１
Apple Pay／Google Pay	標準機能	◯	カード決済と同率
Shop Pay	標準機能	◯	カード決済と同率
コンビニ払い	外部サービス（KOMOJU等）	◯	2.75%前後※2
後払い	外部サービス（Paidy／NP後払い等）	◯	2.5〜5%前後※３ NP後払い・atone＝ネットプロテクションズ公式（取扱高でプラン変動・要問い合わせ）
QR・スマホ決済（PayPay／楽天ペイ／d払い／au PAY／メルペイ）	外部サービス	◯	サービスにより異なる
キャリア決済（ドコモ／au／ソフトバンク）	外部サービス	◯	6%台後半（KOMOJUは物販6.6%）＋月額費・限度額・審査の負担※4
銀行振込／代金引換	外部・運用対応	◯	サービス・運用による
Amazon Pay	—	×	2025年1月終了※5

表で最初に見るべきは「区分」の列です。Shopifyの標準機能は設定画面で有効化するだけで使えますが、外部サービスは決済代行会社との契約と連携作業が加わります。導入の手間と公開までの期間が、ここで変わってきます。

手数料はプランや決済代行サービスによって変動するため、表の数値は目安として扱ってください。

なお、終了したAmazon Payを案内ページに残したままのストアも見られます。過去に導入していた場合は、特定商取引法のページやお支払い方法の記載を見直しておくと、購入者の混乱を防げます。

2.まず入れるべきはShopifyペイメント：これ1つでカード系が揃う理由と操作手順

Shopifyペイメントは、Shopifyが自社で提供する決済サービスです。外部の決済代行会社と契約しなくても、申し込みから売上管理までを管理画面だけで完結できます。この章では、有効化で使えるようになる決済、プランによる手数料の違い、設定の手順、そして利用開始後に注意したい点を順に整理します。

2-1. Shopifyペイメントで使えるようになる決済

Shopifyペイメントの特徴は、有効化すると対応する決済が一括でオンになることです。クレジットカードとデビットカードの受け付けが自動で始まり、Apple Pay・Google Pay・Shop Payも個別の申請なしで使えるようになります。

細かく見ると、JCBを有効にした時点でDiners ClubとDiscoverのカードも自動的に受け付け対象に加わります。これは、JCBがDiscoverのネットワーク（Diners Club・Discoverを含む）加盟店を互いに利用できる提携を結んでいるためです。

なおJCB自体は日本円での国内取引に限られ、海外の購入者の決済には使えません。受け付けるブランドは管理画面の決済設定で確認でき、個別にオン・オフを切り替えられます。

購入者から見ると、カード番号を入力する流れも、スマホをかざすApple Payの流れも、同じチェックアウト画面で選べます。

決済手段ごとに別サービスへ遷移しないため、購入直前の離脱を抑えやすくなります。

有効化した時点で、カード系の決済はまとめて立ち上がります。ここを土台にして、足りない決済だけを外部サービスで補えば、過不足のない構成になります。

2-2. プランで変わる決済手数料の仕組み

Shopifyペイメントの決済手数料は、契約プランと使われるカードの2つで決まります。プランごとの料率は次のとおりです。

プラン	国内発行カード	Amex・海外発行カード
ベーシック	3.55%	3.9%
グロース	3.4%	3.85%
アドバンスト	3.25%	3.8%

(※Shopify公式ブログ ヘルプ「料金プランと請求の概要」)

表の見方は、行がプラン、列がカードの種別です。同じプランでも、Amexや海外発行カードは国内カードより料率が高くなります。これは「国内料率にいくら上乗せ」という足し算ではなく、カード種別ごとに別の料率が決まっている、と捉えると正確です。プランが上がるほど、どちらの料率も下がります。

混同しやすいのが「取引手数料」です。これはShopifyペイメント以外の決済を使ったときに0.6〜2.0%上乗せされる別の費用で、Shopifyペイメントで決済する限りはかかりません。

決済手数料は固定ではなく、プランとカード種別で動きます。なお、大規模向けのShopify Plusは料率が公開されていません。取引量や契約条件に応じてShopifyとの個別契約で決まるため、検討する場合は想定する取引規模を伝えて見積もりを取る形になります。

2-3. 有効化の手順

Shopifyペイメントの有効化は、管理画面だけで完結します。順番は次のとおりです。

1. 設定＞決済を開き、Shopifyペイメントの「アカウントの設定を完了する」を選ぶ
2. ストア通貨を確認する（日本のストアは日本円。初回販売後の変更はサポート対応が必要なため、先に決めておく）
3. ビジネス情報を入力する（法人か個人事業主か、住所、扱う商品の内容、明細書に表示される名称など）
4. 入金先の銀行口座を登録する（日本の口座は漢字・全角で入力）
5. 2段階認証を設定し、利用規約に同意して送信する

設定が完了すれば、クレジットカード・デビットカードに加え、Apple Pay・Google Pay・Shop Payの受け付けが自動で始まります。コンビニ払いやPayPayといった決済は、別の決済代行サービスを追加して有効化する形になります。

2-4. 後日の本人確認と、対面販売には使えない制約

Shopifyペイメントは設定後すぐに使えますが、走り出してから気づくと困るポイントが2つあります。1つは、後から本人確認書類を求められて入金が止まること。もう1つは、実店舗での対面決済には使えないことです。どちらも先に知っておけば、入金トラブルや販売当日の決済不能を避けられます。

まず本人確認です。登録情報だけで身元を確認できない場合、Shopifyから本人確認書類の追加提出を求められることがあります。書類は管理画面のバナーからアップロードする方式で、メールやチャットでは受け付けられません。提出が滞ると入金が保留されることがあり、初回販売から一定期間内に登録を終えないと、注文が自動返金される場合もあります。

もう1つは対面販売です。日本ではShopifyペイメントはオンライン販売専用で、店舗やイベントなどの対面決済（POS）には使えません。実店舗でカード決済を受けたい場合は、外部の決済処理サービスとカードリーダーを別途用意する必要があります。

どちらも事前に把握しておけば対応できます。設定完了後は本人確認書類の提出期限と、対面販売の有無を確認しておきましょう。もし実店舗での販売も予定しているなら、対面決済の手段を別に検討しておくと安心です。

3.標準機能に足す決済は、顧客層と商材で選ぶ

外部で足せる決済は複数ありますが、入れるほど手数料や管理の手間も積み上がります。だからこそ、自社の買い物客に響くものを見極めて選ぶことになります。この章では、コンビニ払い・後払い・QR決済・キャリア決済の4つを取り上げ、それぞれどんな層・商材に効くのかを順に整理します。

3-1. コンビニ払い｜現金で払いたい・カード情報を残したくない人に対応する

コンビニ払いは、クレジットカードを使わない・使いたくない層を取りこぼさないための決済です。注文後に発行される番号をレジで支払う仕組みで、現金で払いたい人や、ネットにカード情報を残すことに抵抗がある人に向きます。

導入は、KOMOJUなどの決済代行サービス経由になります。初期・月額費用は無料で、手数料はコンビニ払いで一律2.75%前後(※KOMOJU料金一覧)が目安です。注意したいのは入金のタイミングで、カード決済のように即時ではなく、買い物客がコンビニで実際に支払ってから売上が確定します。

そのため、支払い前の注文は「まだ入金されていない」状態が続きます。期限内に支払われなければ自動でキャンセルされるため、在庫を一時的に押さえる運用も考えておくと安心です。さらにコンビニ払いには支払い上限（おおむね30万円※KOMOJU「コンビニ決済手数料ガイド」）があり、高額商品の決済には使えないことがあります。

アパレルや服飾雑貨、サプリ・健康食品では、カードを持たない若年層や中高年が買い手になりやすい商材です。こうした層に対して、コンビニ払いは取りこぼし防止に効きます。一方で、入金のずれと上限額をふまえると、高単価中心のストアでは優先度が下がります。

3-2. 後払い｜「届いてから払いたい」高単価・衣類の購入で有効

注文ボタンを押す前に「届いてから払えたら」と感じる買い物客は一定数います。後払いは、その不安に応える決済です。手元に商品が届いてから支払えるため、はじめて使うストアや、高単価でサイズ・質感が気になる商材で購入の後押しになります。

仕組みのポイントは、未回収のリスクをストアではなく後払い事業者が負う点です。代表的なのはPaidy・NP後払い・atoneで、手数料の目安はおおよそ2.5〜5%(※Paidy加盟店（物販3.5%）、KOMOJU「あと支払い3.5%〜」)と、サービスや審査状況によって幅があります。導入には加盟店審査があり、利用開始まで数日から2週間ほどかかる場合があります。

衣類のように「届いて試してから決めたい」商材では、後払いがあるだけで購入のハードルが下がります。返品の可能性とあわせて、後払いと返品ルールをセットで設計しておくと運用がかみ合います。

高単価・サイズ不安のある商材を扱うなら、後払いは客単価とコンバージョンの両面で効きやすい決済です。手数料はカード決済より高めなので、利益率を確認したうえで、後払いを適用する商材カテゴリを絞り込んでください。

3-3. QR・スマホ決済｜PayPayを日常使いする層への対応

国内で7,000万人を超えるとされるPayPayをはじめ(※PayPay公式「登録ユーザー7,000万人突破（2025/7/15）)、スマホで支払う習慣は定着しています。QR・スマホ決済は、この層を取りこぼさないための決済です。PayPayを中心に、楽天ペイ・d払い・au PAY・メルペイをまとめて導入できます。

導入は、KOMOJUやSBペイメントサービスなどの決済代行サービス経由です。手数料の目安はスマホ決済でおおよそ3.5%前後(※KOMOJU「スマホ決済」)からです。スマホアプリ内で支払いが完結するため、決済途中の離脱（カゴ落ち）を抑えやすいのが利点です。

ふだんの買い物をPayPayで済ませている人にとって、見慣れた支払い方法が選べることは安心材料になります。カード入力の手間を避けたい層の受け皿としても働きます。

スマホ中心の若年層や、PayPay利用が定着した層を狙うストアでは、QR・スマホ決済を入れておく価値があります。複数ブランドをまとめて導入できるため、どれか1つというより、主要なものをまとめて入れる形が向いています。

3-4. キャリア決済｜通信料金と合算したい若年層への対応

キャリア決済は、買い物代金を毎月の通信料金とまとめて支払える決済です。ドコモ・au・ソフトバンクの利用者が対象で、クレジットカードを持たない若年層への受け皿になります。

導入はSBペイメントサービスなどの決済代行サービス経由で、手数料の目安は6%台後半（KOMOJUの場合は物販6.6%）と、ほかの決済より高めです。

さらに月額費や限度額の設定、審査もあり、コストと手間の両面で負担が大きい決済といえます。

少額の商品やデジタルコンテンツとは相性がよく、学生など決済手段が限られる層には便利です。一方、手数料が利益を圧迫しやすいため、単価の低い商材で多用すると採算が合わなくなることもあります。

キャリア決済は、ターゲットに若年層が多く、かつ少額商材を扱う場合に検討する決済です。負担が大きいぶん、顧客層がはっきり重なると確認できてから導入を判断してください。

4.決済追加時に確認すべきコスト・運用負担と進め方

決済を1つ足すと、増えるのは選択肢だけではありません。手数料に加えて、月額費や入金管理の手間も乗ってきます。この章では、追加前に見落としやすいコストと運用の負担を押さえたうえで、どの順番で増やすと無理がないかを整理します。

4-1. 月額費・運用工数・入金タイミングのばらつきを事前に把握する

外部決済を足すときに見落としやすいのが、決済手数料以外のコストです。決済の費用には、取引ごとにかかる手数料（変動費）に加えて、サービスによっては毎月の月額費（固定費）もあります。さらにShopifyペイメント以外を使うと、その決済の手数料に取引手数料0.6〜2.0%が上乗せされます。

月額費はサービスで差があります。KOMOJUは初期・月額とも無料で手数料だけですが、SBペイメントサービスやGMOイプシロンのように月額費がかかるサービスもあります。料金は業種や取扱高に応じた個別見積もりが多いため、各サービスの公式サイトで最新の料金を確認してください。

つまり、月額費のかかるサービスでは、利用が少なくても固定費が毎月発生し続けます。

入金のタイミングも決済ごとに異なります。カード決済は最短5営業日ほどで入金されますが、コンビニ払いや後払いは入金までの期間が長く、ばらつきも大きくなります。決済が増えるほど、いつ・いくら入るのかの管理が複雑になり、資金繰りにも影響します。

運用面でも、コンビニ払いの未入金チェックや期限切れ注文の処理、決済ごとの入金の照合・消し込みといった手間が積み上がります。

利用の少ない決済を「とりあえず」入れておくと、売上にひもづく手数料はかからなくても、月額の固定費だけが毎月残ることになります。

決済を足す前に、その決済の月額費・手数料・入金タイミングをセットで確認しておくと、あとから「思ったより負担が重い」となりにくくなります。決済ごとに並べたコスト表を一度つくっておくと、判断がぶれません。

4-2. 最小構成から始め、効果を確認しながら決済方法を追加する

開店時から決済をすべてそろえると、ほとんど使われない決済の固定費や管理の手間だけが残ることがあります。まずはShopifyペイメント中心の最小構成で始め、反応を見ながら足していくほうが無駄がありません。

判断材料になるのが、Shopifyの財務レポートです。決済ごとの取引状況を確認できるため、どの決済が実際に使われているかが見えてきます。チェックアウトでの離脱（カゴ落ち）の傾向もあわせて見れば、足りない決済を根拠を持って補えます。

たとえばPayPayを入れて利用が伸びれば続け、ほとんど使われなければ停止を検討します。実際の利用に合わせて調整すれば、手数料と固定費をかけた分が売上につながりやすくなります。スタートの目安は、Shopifyペイメント（カード系）に、顧客層の決済習慣に合わせて1つ追加する構成です。

スマホ決済が日常の若年層が中心ならPayPay、カードを持たない・カード情報を入力したくない層が中心ならコンビニ払い、というように、ターゲットがふだん使う決済から選ぶと無理がありません。

5.よくある質問（FAQ）

Q1．決済方法は、後から追加・変更できますか？

はい。管理画面の設定＞決済から、公開後でもいつでも追加・変更できます。新しい決済代行サービスを足したり、使われていない決済をオフにしたりも随時可能です。切り替えのときは、チェックアウト画面での表示と、進行中の注文への影響を確認しておくと安心です。

Q2．海外のお客さんの決済（越境）はどうすればいいですか？（PayPal等）

海外発行カード自体は、Shopifyの標準機能（Shopifyペイメント）でそのまま受け付けられます。そのうえで、海外のお客さんに現地通貨で表示・決済してもらうにはShopify Markets（多通貨対応）を使い、海外で利用率の高いPayPalは、ストア開設時から標準で連携されているPayPal Express Checkoutを有効化して対応できます。なお、本文で触れたとおりJCBは日本円・国内取引に限られます。越境販売を検討する場合は、関税・配送・通貨設定など決済以外の要件も別途整理してください。

Q3．公開前に、決済が正しく動くかテストできますか？

はい。Shopifyペイメントにはテストモードがあり、実際の請求を発生させずに決済の流れを確認できます。公開前にテスト購入をして、注文から決済、注文通知メールまでが一通り動くかをチェックしておくと安心です。テスト後は、本番前にテストモードを必ずオフに戻します。(※Shopifyヘルプ「Shopify ペイメントのテスト」)

Q4．特定商取引法で、決済方法の表記は必要ですか？

はい。特定商取引法に基づく表記では、支払方法や支払時期などの記載が求められます。(※消費者庁 特定商取引法ガイド「通信販売広告について」)Shopifyでは設定＞ポリシーの特定商取引法ページで編集できます。決済を追加・変更したら、この表記と「お支払い方法」ページもあわせて更新してください。なお、記載項目の詳細は消費者庁の最新情報を確認するか、専門家にご相談ください。

6.まとめ

決済は、最初から全部そろえるものではなく、自社の買い物客に合わせて組み立てるものです。カード系はShopifyの標準機能（Shopifyペイメント）で立ち上がるので、まずはここを土台にします。そのうえで、コンビニ払い・後払い・QR決済・キャリア決済から、ターゲットの決済習慣に重なるものを選んで足していきます。

決済を増やすときは、手数料だけでなく月額費や入金タイミング、運用の手間まで見て判断します。財務レポートで実際の利用を確認しながら最小構成から少しずつ広げれば、かけたコストが売上につながりやすくなります。自社の顧客層を思い浮かべ、まず1つ加える決済を決めるところから始めてみてください。

自社の顧客層をどう捉えればいいか分からない、どの決済を入れれば取りこぼしを防げるか判断しきれない、という場合は、Raboにご相談ください。Shopifyの構築・運用支援の中で、顧客層の整理から、その層に合う決済構成の設計までお手伝いします。